Neden BA.2 Omicron’u Çağıramıyoruz?


2020’nin sonlarında koronavirüs varyantları tüm gücüyle ortaya çıktığında, haberler bir anda alfanümerik çorbaya dönüştü. Unutma? Birleşik Krallık varyantı, B.1.351, GR/501Y.V3. Bu ilk kaos döneminden sonra, Dünya Sağlık Örgütü bu varyantları sırasıyla Alfa, Beta ve Gama olarak yeniden adlandıran akıl sağlığını koruyan bir sistem geliştirdi. Ve Omicron’a varana kadar Yunan alfabesine geçtik. Sistem çalıştı.

Ancak son zamanlarda, Omicron sonrası haber ortamı tekrar alfanümerik çorbaya dönüşüyor. adlı bir Omicron alt varyantı BA.2 şimdi küresel olarak baskın. BA.4 ve BA.5 sahip olmak yeni keşfedildi. Ve yeni rekombinantlardan oluşan bir bereket, bazı anlaşılmaz mantığı takip ediyor gibi görünen isimlere sahip: XD (Delta ve BA.1’in bir rekombinantı), XE (BA.1 ve BA.2’nin bir rekombinantı), XF (a farklı Delta ve BA.1)’nin rekombinantı, vb. XS (Delta ve BA.1.1’in bir rekombinantı).

Size isimlerin aslında tutarlı bir iç mantığı izlediğini söylesem, yardımcı olur mu? 1.800 kelime kuralları koymak? Numara? Tamam, bunun yerine kuralların nereden geldiğini ve DSÖ’nün çok daha basit Yunan harfli sistemine rağmen neden hala kullanıldığını açıklamaya çalışacağım.

Mart 2020’de viral evrimi inceleyen bilim adamları, yeni koronavirüsün nasıl değiştiğini izlemeye başladılar. Çok temel bir iletişim sorunuyla karşılaştılar: Genomu dizilendikten sonra yeni bir soy ne denir? “ABD’deki insanlar buna tek bir şey diyordu; Avrupa’daki insanlar buna bir başkası diyorlardı” diyor Edinburgh Üniversitesi’nde doktora sonrası araştırmacı olan Áine O’Toole. Yani O’Toole’un danışmanı Andrew Rambaut ve bir grup işbirlikçi bir adlandırma sistemi ile geldi. Adını Pango koydular. Ve şu anda Pango’nun soy belirleme komitesinin başkanı olan O’Toole, adı verilen bir yazılım parçası üzerinde çalıştı. karıncayiyenBu, bilim adamlarının herhangi bir viral genoma olası bir Pango adı atamasına izin verdi.

(Evet, pango olan pangolinlere yapılan bir göndermedir. kısaca şüphelenildi takımın hesaplama araçlarından birkaçı olan koronavirüsün kökeninde bir rol oynamış olmak hayvanların isimleriyle anılır-ve evet, bu kafa karıştırıcı oldu pangolin soyu pangolinlerde bulunan viral soylar veya pangolin aracı tarafından atanan soylar anlamında kullanılabilir. Yine, kendi aralarında konuşan bilim adamları, kendi jargonlarının başkaları tarafından nasıl yorumlanabileceğini tam olarak tahmin etmediler.)

Bu noktada, varyantların pandemide oynayacağı dramatik rolü henüz kimse bilmiyordu. Bilim adamları daha çok görmek için soyları takip etmekle ilgileniyorlardı. virüs nasıl yayıldı ülkeden ülkeye. Ve ilk başta koronavirüsün yalnızca iki ana soyu vardı: A ve B. Virüs dünyanın farklı yerlerinde farklı mutasyonlar edindikçe, bilim adamları Pango sistemini sayılar ekleyerek alt soyları adlandırmak için kullandılar. Örneğin B.1.1.7, B.1.1’in keşfedilecek yedinci alt-soyudur ve bu da B.1’in keşfedilen ilk alt-soyudur. B.1.1.7’yi “Alfa” olarak daha iyi biliyor olabilirsiniz. O’Toole, BBC’nin 2020’de Noel’de “B.1.1.7” hakkında yaptığı konuşmaya kulak misafiri olduğunu hatırlıyor. “Benim için çok gerçeküstüydü” dedi. “Kız kardeşime ‘Oh, oradaki ismi biliyor musun?’ dediğimi hatırlıyorum. Ve ‘Evet, korkunç’ diyor.” Bu isimler çok sayıda farklı varyantı izleyen bilim adamları için tasarlandı. Genel halk için, “B.1.1.7, B.1.351 ve B.1.128’i ayırmanın ne kadar zor olacağını düşünmemiştik” dedi.

Yine de 2020’nin sonlarına kadar, genel halkın farklı soyları birbirinden ayırmasına gerçekten gerek yoktu. Alfa, pandeminin gidişatını gerçekten değiştiren ilk varyanttı. Dünyanın artık “epidemiyolojik olarak önemli varyantları” “basitçe var olan varyantlardan” ayıran bir sisteme ihtiyacı vardı. DSÖ Yunanca harfli sistem birincisini, Pango sisteminin ikincisini yapmak içindir.

Omicron işleri biraz daha karmaşık hale getirse de, bu sorumluluk bölümü oldukça iyi çalıştı. DSÖ’nün orijinal olarak Omicron olarak adlandırdığı varyant, Pango altında B.1.1.529 olarak adlandırılır. Bilim adamları daha sonra hızla Omicron’un BA.1, BA.2 ve BA.3 olarak bildiğiniz başka alt varyantlarını buldular. Bunun nedeni, Pango isimlendirme sisteminde adlar çok uzun olduğunda, adın ilk bölümünün yeni bir harfle veya tüm tek harfler alınmışsa bir çift harfle değiştirilmesidir. Omicron alt varyantları tanımlandığında, bir sonraki uygun harf çifti şuydu: BA. Yani B.1.1.529.2 yerine BA.2’ye sahibiz. Şans eseri, nispeten hatırlaması kolay bazı Omicron alt varyant isimleri bulduk.

BA.1 ve BA.2, Avrupa’nın bazı bölgelerinde birbirini izleyen büyük dalgalara neden oldu. İki alt değişken aslında birbirinden oldukça farklıdır, neredeyse evrimsel olarak birbirinden farklıdır. Alfa, Delta’dandı.. Ancak DSÖ, Şubat ayında BA.2’nin hala dikkate alınması gerektiğine karar verdi. Omikronve daha yakın zamanda BA.4 ve BA.5’in de olması gerektiğine karar verdi. Bir Omicron alt varyantı, aslında yeni bir Yunanca harf alacak kadar farklı görünebilir ve davranabilir mi? Geriye dönüp bakıldığında, BA.2 biraz tartışmalı bir bölgeye düşüyor: BA.2 dalgası, bazı Avrupa ülkelerinde orijinal BA.1 dalgasından daha büyük olmasa da büyük oldu, ancak henüz o kadar dramatik görünmüyor. ABD O’Toole, bir soya mümkün olan en kısa sürede bir isim vermek ile epidemiyolojik önemini bildiğiniz zaman bir isim vermek arasında bir denge olduğunu söyledi. Yunanca harfli adlarla varyantları belirlemeye ne kadar erken çalışırsak, potansiyel olarak neler yapabilecekleri hakkında o kadar az şey biliriz. DSÖ ayrıca, Epsilon, Eta, Iota ve Lambda gibi pek çok ilgi çekici varyant belirlemiştir ve bunlar, büyük bir epidemiyolojik etki yaratmamıştır.

Son aylarda daha fazla rekombinant da ortaya çıktı ve bu bir tesadüf değil. Bu koronavirüs, diğer koronavirüsler gibi, her zaman rekombinasyon yeteneğine sahiptir. Ancak başlangıçta, farklı soylar birbirine o kadar benziyordu ki, yeniden birleştirme sadece çok benzer dizileri değiştirmek anlamına geliyordu – başka bir deyişle, pek bir şey ifade etmiyordu. Ancak son zamanlarda dünyanın bazı bölgelerinde bir Delta dalgası, ardından bir BA.1 dalgası ve ardından bir BA.2 dalgası görüldü. Birkaç farklı soyun yüksek ortak dolaşımı, rekombinasyon için daha fazla potansiyel anlamına gelir. Pango sistemi, mektubu saklayarak baştan rekombinantları öngördü. X rekombinant soylar için. Sonra sadece alfabeye gidin ve her zamanki gibi harf veya sayı eklemeye devam edin. DSÖ izleme bir rekombinant, XD ve herhangi bir rekombinant vakaları yukarı çekmeye başlarsa, onlar da Yunanca harfli bir isim alabilirler. Kafa karıştırıcı Pango isimlerine sahip yeni soyların, daha onların önemini anlamadan önce haber haline gelmesi, medyanın ve halkın viral evrimin özüne olan ilgisinin gerçekten alışılmadık bir düzeyini yansıtıyor.

Yunan alfabesini izleyen bir adlandırma sistemi, yeni varyantların doğrusal bir ilerlemesini ima ediyor gibi görünebilir. Ancak viral evrim daha çok bir ağaç dalını izlemek ve büyümek gibidir. Ve hangi dalların bodurlaşacağını ve hangilerinin dallarla uzayıp yoğunlaşacağını bilemezsiniz. Hangi uzak dalların birbiriyle kaynaşıp, kendisi uzun ve yoğun büyüyen bir yeniden birleşen dal oluşturacağını da bilemezsiniz. Yunan harfli sistem, bu viral evrim ağacındaki en önemli dalları vurgulamayı amaçlıyor. Ama her şeyi kapsamaz – hatta yakın bile değil. Pango sistemi şimdi, çoğunluğu bilinmezliğe mahkum edilmiş 2.000’den fazla soyu kapsamaktadır. Ve büyük olasılıkla, bugün haberlerde yer alan alfanümerik çorba isimlerinin çoğu da yakında belirsizliğe geri dönecek. Eğer yapmazlarsa, o zaman muhtemelen hepimizin öğrenmesi gereken yeni bir Yunanca harf olur.




Kaynak : https://www.theatlantic.com/science/archive/2022/04/covid-variant-naming-omicron-ba2/629558/?utm_source=feed”>Source link

Yorum yapın